근로시간에 속하는지 휴게시간에 속하는지는 특정 업종이나 업무의 종류에 따라 일률적으로 판단할 것이 아니다. 이는 근로계약의 내용이나 해당 사업장에 적용되는 취업규칙과 단체협약의 규정, 근로자가 제공하는 업무의 내용과 해당 사업장에서의 구체적 업무 방식, 휴게 중인 근로자에 대한 사용자의 간섭이나 감독 여부, 자유롭게 이용할 수 있는 휴게 장소의 구비 여부, 그 밖에 근로자의 실질적 휴식을 방해하거나 사용자의 지휘·감독을 인정할 만한 사정이 있는지와 그 정도 등 여러 사정을 종합하여 [개별 사안]에 따라 구체적으로 판단하여야 한다.
http://www.law.go.kr/LSW/precInfoP.do?precSeq=186261

요즘은 사측 노무사들이 법으로 따지기는 기회비용상 괴로운 선에서 야금야금 세팅해놓는 경우가 많아서(ex. 포괄임금제 상의 연차수당 미리 지급 등) 퇴직금 분할 약정 같이 법으로 결딴내기 전에는 개인적인 선에서 대응하기가 쉽지 않습니다.
심지어 영업양도 국면이시라 더더욱 문제제기 하시기는 어려우실 거 같은데.. 주변 공단 같은데서 운영하는 무료노무상담센터 같은 곳에 알아보시는 것이 가장 확실한 방법입니다.